Коллекция предназначена как для учебных (практических занятий школьников, студентов и аспирантов), так и для научно-исследовательских (изучение морфологических, экологических, физиолого-биохимических, молекулярных и т.д. свойств штаммов грибов) целей. Коллекция будет постоянно пополняться штаммами сапротрофных и потенциально патогенных микроскопических грибов из природных ненарушенных (из разных климатических зон России, и также из экстремальных условий - аридных, криоаридных, засоленных и проч., например, Антарктиды, пустынных регионов Азии) и антропогенных местообитаний. Особое внимание будет уделено местообитаниям с максимальной плотностью населения, т.е. городским экосистемам, в которых вопросы биологического загрязнения окружающей среды и контакта человека с потенциально опасными микроорганизмами наиболее актуальны. В коллекцию будут введены штаммы из почв и почвоподобных тел, морских грунтов, морской и пресной вод, из воздуха, с поверхности растений и строительных сооружений. В коллекции будут представлены штаммы культивируемых микроскопических грибов, таксономическая принадлежность которых будет определена как по культурально-морфологическим, так и по молекулярным свойствам.